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Qiagen 51304 基因組DNA小提試劑盒科研應(yīng)用指南

更新時(shí)間:2025-04-10      點(diǎn)擊次數(shù):204

Qiagen 51304 基因組DNA小提試劑盒科研應(yīng)用指南

——高效、高純度基因組DNA提取的標(biāo)準(zhǔn)化解決方案

一、產(chǎn)品原理與核心優(yōu)勢

1.1 技術(shù)原理

 

硅膠膜離心柱技術(shù):

 

選擇性結(jié)合DNA>100 bp),高效去除蛋白質(zhì)、RNA及小分子污染物

 

基于pH調(diào)控的吸附/洗脫機(jī)制(裂解液pH=8.0,洗脫液pH=8.5

 

關(guān)鍵步驟:

 

細(xì)胞裂解(蛋白酶K+Buffer ATL

 

核酸吸附(Buffer AL+乙醇)

 

雜質(zhì)去除(Buffer AW1/AW2洗滌)

 

DNA洗脫(Buffer AE或水)

 

1.2 性能參數(shù)

 

指標(biāo) Qiagen 51304 傳統(tǒng)酚-氯仿法

得率(哺乳動(dòng)物細(xì)胞) 5-10 μg/10? cells 3-8 μg/10? cells

A260/A280 1.7-1.9 1.6-1.8(常含酚殘留)

操作時(shí)間 20-30分鐘 2-3小時(shí)

最大樣本量 5×10? cells25 mg組織 需分多次處理

1.3 適用樣本類型

 

推薦樣本:

? 培養(yǎng)細(xì)胞(貼壁/懸浮)

? 動(dòng)物組織(肝、脾等軟組織優(yōu)先)

? 血液(需配合紅細(xì)胞裂解步驟)

 

不推薦樣本:

? 植物組織(需專用試劑盒)

? 石蠟包埋樣本(需脫蠟預(yù)處理)

 

二、標(biāo)準(zhǔn)化操作流程

2.1 實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

 

試劑預(yù)冷:Buffer AW1/AW24℃保存,使用前室溫平衡

 

樣本預(yù)處理:

 

復(fù)制

貼壁細(xì)胞:胰酶消化后PBS重懸  

組織樣本:液氮研磨至粉末狀  

2.2 詳細(xì)操作步驟

 

復(fù)制

1. 裂解:  

   - 20 μL蛋白酶K + 200 μL Buffer ATL  

   - 56℃孵育10分鐘(組織需延長至30分鐘)  

2. 結(jié)合:  

   - 200 μL Buffer AL + 200 μL乙醇(96-100%)  

   - 渦旋混勻15秒  

3. 過柱:  

   - 轉(zhuǎn)移混合液至離心柱,≥6000 g離心1分鐘  

4. 洗滌:  

   - 500 μL Buffer AW1,離心1分鐘  

   - 500 μL Buffer AW2,離心3分鐘(確保去鹽)  

5. 洗脫:  

   - 50-100 μL Buffer AE,室溫靜置5分鐘后離心  

2.3 關(guān)鍵優(yōu)化點(diǎn)

 

提高得率:

 

延長組織裂解時(shí)間至2小時(shí)

 

二次洗脫(使用同一洗脫液)

 

提高純度:

 

增加AW2洗滌離心至5分鐘

 

洗脫前空離2分鐘去除殘留乙醇

 

三、質(zhì)量評(píng)估與問題排查

3.1 質(zhì)檢標(biāo)準(zhǔn)

 

純度合格:A260/A280=1.7-1.9A260/A230>2.0

 

完整性驗(yàn)證:

? 0.8%瓊脂糖凝膠電泳,主帶>10 kb(無拖尾)

? 適用于PCRSouthern blot等下游應(yīng)用

 

3.2 常見問題診斷

 

現(xiàn)象 可能原因 解決方案

得率低 /乙醇比例錯(cuò)誤 增加蛋白酶K用量/檢查乙醇濃度

A260/A280異常 蛋白質(zhì)或酚殘留 增加AW2洗滌步驟

DNA降解 樣本反復(fù)凍融/RNase污染 使用新鮮樣本/添加RNase抑制劑

3.3 應(yīng)用案例數(shù)據(jù)

案例1:小鼠尾尖基因分型

 

結(jié)果對(duì)比:

 

復(fù)制

Qiagen 51304:平均得率8.2 μgPCR成功率98%  

CTAB法:平均得率5.1 μgPCR成功率85%  

案例2FFPE樣本提取

 

優(yōu)化方案:

 

增加蛋白酶K40 μL,裂解過夜

 

得率提升3倍(從0.5 μg1.5 μg/10 μm切片)

 

四、技術(shù)問答(Q&A

Q1:能否用于微量樣本(<10? cells)?

 

需配合 載體RNA(如Qiagen 1017456) 提高回收率(建議終濃度5 ng/μL

 

Q2:洗脫緩沖液選擇建議?

 

Buffer AE:含EDTA,適合長期儲(chǔ)存(-20℃)

 

無菌水:適用于立即使用的PCR等應(yīng)用

 

文檔優(yōu)化建議:

 

插入 【電泳檢測示例圖】 標(biāo)注完整性與降解DNA區(qū)別

 

添加 得率計(jì)算工具 二維碼(鏈接至在線計(jì)算器)

 

關(guān)鍵步驟用 ??注意 標(biāo)注(如"勿讓離心柱干燥"


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